拉卡拉POS机刷卡手续费并非由单一机构收取，而是由发卡行、清算机构和收单机构三方共同分配。

具体来说，手续费的主要部分流向发卡行，即持卡人所属的银行。发卡行在交易中承担了资金垫付和风险管理的责任，因此收取一定比例的服务费，这部分费用通常占手续费的70%左右。例如，在一笔10000元的信用卡交易中，发卡行可能会收取约42元的手续费。

清算机构（如中国银联）也会从手续费中分得一部分。清算机构负责交易信息的传递和资金的清算，确保交易能够顺利完成。清算机构收取的网络服务费通常占手续费的10%左右，用于维护支付系统的稳定运行，确保交易的安全性和高效性。在上述例子中，清算机构可能会收取约6元的手续费。

收单机构（如拉卡拉）作为POS机服务的提供方，同样会从手续费中获得一定比例的收入。收单机构负责为商户提供POS机设备、技术支持以及资金结算服务，因此收取的服务费通常占手续费的20%左右。这部分费用用于覆盖设备成本、运营成本以及提供客户服务的费用。在上述例子中，收单机构可能会收取约12元的手续费。

需要注意的是，手续费的具体分配比例并非固定不变，而是根据交易类型、行业属性以及商户与支付机构的协议有所不同。例如，信用卡交易的手续费通常高于借记卡交易，因为信用卡交易涉及更高的风险成本。